Do Rishonim Always Know the Metzi’us?

No, of course not. There is such an opinion regarding Chazal, but not for the Rishonim.

This has bearing on questions of Techeiles, Kazayis, and so on.

Rabbi Meir Mazuz recently quoted this in a lecture.

רש”ש כתובות ז’ ב’:

בא”ד כדאמרינן הלל ושמעון כו’… ודע דהמאור עינים בפ’ נ”א ונ”ב הוכיח בראיות עצומות שמונבז והילני אמו לא היו מזרע בית חשמונאים כי אם גרי צדק בכמו כ”ה שנים קודם חורבן הבית וכ”כ בסה”ד בשם היוחסין. וא”כ א”ש הורוה ב”ה כפשטיה.

In other words, Rashi just assumed.